ВТ ЦСКА е основан през 1948 г. като част от спортното дружество ЦСКА. През годините се налага като най-успешния отбор по водна топка в България.
ЦСКА е отборът с най-много спечелени титли в България за мъже – 38, както и с най-големи успехи на международната сцена.
ЦСКА е шампион на България през следните години: 1952, 1961 – 1966, 1969, 1973 – 1977, 1979 – 1986, 1988, 1989, 1992, 1994, 1995, 1998, 1999, 2000, 2001, 2003, 2005, 2006, 2007, 2011, 2012, 2014, 2015.
Клубът е печелил над 30 пъти Купата на България. Школата на ЦСКА е създала повечето от легендарните български състезатели по водна топка, включително и най-успешния зад граница български ватерполист Свилен Пиралков – голмайстор на Европа за 2011/2012 и настоящ треньор на националния отбор на Испания.
